В структуру больницы входят 13 клинических отделений, из них 8 отделений хирургического профиля - общая хирургия, травматология (в том числе нейрохирургия), челюстно-лицевая хирургия, стоматология, гинекология, урология - и 6 отделений терапевтического профиля - гематология, кардиология, неврология, гемодиализ и терапия (в том числе нефрология). Кроме того имеются 7 отделений обеспечения: 2 отделения реанимации для больных хирургического профиля, кардиореанимация, 2 операционных отделения, отделение гравитационной хирургии крови, отделение переливания крови и межрайонный гематологический кабинет.