Больница является крупнейшим многопрофильным стационаром не только в Санкт-Петербурге, но и в Северо-Западном регионе и ведет свою историю с 1835 года. Именно тогда была открыта вторая по величине в Европе «Императорская Николаевская Детская больница», предназначенная для малолетних детей из неимущественных слоев, подверженных инфекционным и детским болезням. С 1918 года клиника носит имя прославленного русского педиатра Нила Федоровича Филатова.
На сегодняшний день ДГКБ №5 им. Н.Ф. Филатова - многопрофильное лечебное учреждение мощностью 585 коек, в структуру которого входят 17 специализированных лечебных отделений, отделение анестезиологии и реанимации, отделение лучевой диагностики (МРТ, КТ), клинико-диагностическая лаборатория, отделения ультразвуковой и функциональной диагностики, амбулаторно-консультативное отделение и многие другие. На базе нашего стационара функционирует Центр эндовидеохирургии. Многие отделения являются уникальными для Санкт-Петербурга, например, отделение детской и подростковой гинекологии, где проводится плановое и экстренное оперативное лечение с применением лапароскопической аппаратуры, большой спектр диагностических и клинико-лабораторных обследований.